En la tercera temporada, la amenaza venía de un grupo terrorista que tenía la intención de liberar un peligroso virus mortal en Los Angeles coincidiendo con la visita del presidente Palmer a la ciudad para debatir con su rival a la presidencia de los Estados Unidos.

El personaje central de la serie es el agente Jack Bauer (Kiefer Sutherland, Tiempo de matar), que trabaja en la Unidad Antiterrorista de Los Angeles y cuyo trabajo es impedir acciones violentas contra los Estados Unidos y que en cada temporada se enfrenta a retos aún mayores.